Os Serviços Financeiros exercem as suas atribuições nos domínios financeiros e patrimoniais do ISEL compreendendo quatro núcleos:
- Núcleo de Orçamento e Contabilidade - compete assegurar a correta gestão orçamental e o funcionamento do sistema de contabilidade, respeitando as considerações técnicas, os princípios e as regras contabilísticas, de modo a garantir a sua regulamentação e aplicação.
- Núcleo de Aprovisionamento e Património - compete assegurar o aprovisionamento e a gestão patrimonial do ISEL, garantindo a correta gestão das aquisições e procedendo à organização e atualização dos ficheiros do património do ISEL.
- Núcleo de Tesouraria - compete controlar a receita escolar e não escolar e o pagamento das despesas nos termos legais e regulamentares e no respeito das normas e procedimentos dos Serviços Financeiros.
- Núcleo de Projetos - compete assegurar a organização administrativa, contabilística e financeira de projetos do ISEL.
