O ISEL conta atualmente com unidades de investigação e desenvolvimento em diferentes áreas do conhecimento que possibilitam uma pronta resposta aos mais diversos desafios da sua empresa e da sociedade. 

⬩ CCISEL - Centro de Cálculo
⬩ CEDET - Centro de Estudos e Desenvolvimento de Electrónica e Telecomunicações
⬩ CEEC - Centro de Estudos de Engenharia Civil
⬩ CEEI - Centro de Electrotecnia e Electrónica Industrial
⬩ CEEM - Centro de Estudos de Engenharia Mecânica
⬩ CEEQ - Centro de Estudos de Engenharia Química
⬩ CF - Centro de Física
⬩ CIC - Centro de Instrumentação e Controlo
⬩ CIEQB - Centro de Investigação de Engenharia Química e Biotecnologia
⬩ CIMOSM – Centro de Investigação em Modelação e Optimização de Sistemas Multifuncionais
⬩ CIPROMEC - Centro de Investigação e Projecto em Controlo e Aplicação de Máquinas Eléctricas
⬩ CM - Centro de Matemática
⬩ GIAMOS - Grupo de Investigação Aplicada em Microelectrónica, Optoelectrónica e Sensores
⬩ GIATSI - Grupo de Investigação Aplicada em Tecnologias e Sistemas de Informação
⬩ GIEST - Grupo de Investigação em Electrónica de Sistemas e de Telecomunicações
⬩ GIA2P2 - Grupo de Investigação em Aplicações Avançadas de Potência Pulsada
⬩ GiSE - Grupo de Investigação em Sistemas de Energia
⬩ GuIAA - Grupo de Investigação em Ambientes Autónomos
⬩ GRC - Grupo de Redes de Comunicação
⬩ FIT - Future Internet Technologies
⬩ LCEC - Low Carbon Energy Conversion R&D Group
⬩ M2A - Grupo de Multimédia e Aprendizagem Automática
⬩ UnIRE - Unit for Innovation and Research in Engineering