A matemática é um dos alicerces fundamentais dos profissionais que o mercado de trabalhos tanto necessita e que o ISEL tem capacidade de formar, os quais, para além de uma sólida formação nesta área, possuem capacidades efetivas na sua aplicação a problemas concretos. O Departamento de Matemática (DM) mune os alunos do ISEL com conceitos e métodos matemáticos indubitavelmente necessários ao desenvolvimento técnico-científico de muitas áreas da nossa sociedade, tais como engenharias e ciências naturais, medicina, economia e finanças ou ciências sociais.

O Departamento de Física (DF) é responsável pelo ensino de graduação e pós-graduação na área científica de Física de diferentes cursos de Engenharia do ISEL, visando munir os seus alunos de uma sólida formação em Física e de um sentido crítico apurado, cientificamente sustentado. A transmissão de conhecimentos teóricos fomentada pelo DF está alicerçada numa forte componente experimental, destinada a desenvolver a capacidade técnico-científica dos alunos de engenharia.